- Oberarzt an der Hämato-Onkologie des Klinikum Brandenburg an der Havel
- Mitbegründer und Mitgeschäftsführer des Forschungsinstituts Havelhöhe gGmbH
- Internistische Onkologie im MVZ Havelhöhe
Burkhard S. Matthes ist Facharzt für Innere Medizin mit Schwerpunkt Onkologie und Pneumologie. Von 2005 bis 2008 ambulant niedergelassen in Berlin Spandau mit hausärztlicher Praxis und onkologischem Schwerpunkt, anschließend bis heute im MVZ angestellt.
Seit 2014 tätig als Weiterbildungsarzt und Oberarzt in der Hämato-Onkologie des Klinikum Brandenburg an der Havel, Medizinische Hochschule Brandenburg.
Seit 1999 Vorstand des Trägervereins des Gemeinschaftskrankenhauses Havelhöhe, Verein zur Förderung und Entwicklung anthroposophisch erweiterter Heilkunst. 2005 bis 2015 Geschäftsführer des Trägers der Medizinischen Versorgungszentren, der AnthroMed Berlin-Brandenburg gGmbH.
Burkhard S. Matthes ist Mitglied der Arzneimittelkommission am BfArM (Kommission C), des Sachverständigenrates für die Verschreibungspflicht von Arzneimitteln nach §53 Abs. 2 AMG vom 14.01.2014 am BfArM sowie in verschiedenen Ausschüssen der Kassenärztlichen Vereinigung Berlin.